Dataset : CECURE-Contamination of the Environment and Circulation in Urban and Rural areas of Echinococcus multilocularis

Access to data

Rights

Collection	CNR Echinococcoses

Quotation

Jenny Knapp (2018): CECURE-Contamination of the Environment and Circulation in Urban and Rural areas of Echinococcus multilocularis. Chrono-environnement. doi:10.25666/DATAOSU-2018-05-17

General metadata

Identifier : local : FR-18008901306731-2018-05-17 external : doi:10.25666/DATAOSU-2018-05-17

Description :

A copro-sample collection was created for the CECURE project. The aim of this study was to assess the relative role of carnivore hosts (mainly fox, dog, cat) in the speading and circulation of the parasite Echinococcus multilocularis in the urban and rural environnement in order to assess the exposure risk of human population with the cestode in these two types of environment.

Disciplines :

ecology (applied biology - ecology), cell biology (fundamental biology), parasitology (fundamental biology)

Keywords :

copro-qPCR diagnosis, definitive host, Echinococcus multilocularis, host faecal test, parasite environmental distribution pattern, risk of transmission

Dates :

Data acquisition : from 19 Mar 2012 to 19 Mar 2015

Data provision : 17 May 2018

Metadata record :

Creation : 17 May 2018

Update : 22 May 2018

Update periodicity : as needed

Language : English (eng)

Audience : Research

Coverages

Spatial coverage :

Nord-Est de la France: on Earth, latitude between 48° 57' 36" N and 46° 57' N, longitude between 2° 13' 12" E and 6° 27' E

Time coverage :

Between 2012-03-19 and 2015-03-19

Taxonomic coverage :

Carnivore émetteurs des fèces collectées et parasite étudié

Species
Vulpes vulpes (Red fox), Felis catus (Domestic Cat), Meles meles (European badger), Martes foina (stone marten), Echinococcus multilocularis (Echinococcus multilocularis tapeworm)
Subspecies
Canis lupus familiaris (Dog)

Administrative metadata

Data creator	Affiliation
Jenny Knapp	Chrono-environnement

Contributors	Affiliation	Role
Patrick Giraudoux	Chrono-environnement	research group
Benoît Combes	ELIZ	research group
Gérald Umhang	ANSES - LNR Echinococcus	research group
Franck Boué	ANSES - LNR Echinococcus	research group
Laurence Millon	CHRUB	research group
Francis Raoul	Chrono-environnement	research group

Publisher : Laboratoire Chrono-environnement

Labels : Centres Nationaux de Référence, Institut Ecologie Environnement

Science contact : Jenny Knapp

Computing contact : Sylvie Damy

Project and funder :

CECURE - Contamination of the Environment and Circulation in Urban and Rural areas of Echinococcus multilocularis
- INEE - CNRS Interdisciplinary program “Transmission ecology of alveolar echinococcosis” (CNRS)

Access : available

Technical metadata

Formats : text/csv

Data acquisition methods :

Observational data :
Les échantillons ont été collectés sur le terrain. Un code leur a été alors attribué, ils ont été géoréférencés, l'identification morphologique de l'hôte carnivore réalisée, ainsi que l'estimation de la fraicheur, le tout consigné sur le terrain.
Experimental data :
La détection du parasite et le test fécal de l'hôte ont été réalisés par biologie moléculaire utilisant la méthode de PCR en temps réelle basée sur la détection spécifique de l'ADN recherché.

Datatype : Dataset