Dataset : CECURE-Contamination of the Environment and Circulation in Urban and Rural areas of Echinococcus multilocularis

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Collection

Quotation

Jenny Knapp (2018): CECURE-Contamination of the Environment and Circulation in Urban and Rural areas of Echinococcus multilocularis. Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249). doi:10.25666/DATAOSU-2018-05-17

General metadata

Identifier : local : FR-18008901306731-2018-05-17 external : doi:10.25666/DATAOSU-2018-05-17
Description :
A copro-sample collection was created for the CECURE project. The aim of this study was to assess the relative role of carnivore hosts (mainly fox, dog, cat) in the speading and circulation of the parasite Echinococcus multilocularis in the urban and rural environnement in order to assess the exposure risk of human population with the cestode in these two types of environment.
Disciplines :
ecology (applied biology - ecology), cell biology (fundamental biology), parasitology (fundamental biology)
Keywords :
copro-qPCR diagnosis, definitive host, Echinococcus multilocularis, host faecal test, parasite environmental distribution pattern, risk of transmission
Dates :
Data acquisition : from 19 Mar 2012 to 19 Mar 2015
Data provision : 17 May 2018
Metadata record :
Creation : 17 May 2018
Update : 12 Jul 2021
Update periodicity : as needed
Language : English (eng)
Audience : Research

Coverages

Spatial coverage :

  • Nord-Est de la France: latitude between 48° 57' 36" N and 46° 57' N, longitude between 2° 13' 12" E and 6° 27' E

Time coverage :

Taxonomic coverage :

  • Carnivore émetteurs des fèces collectées et parasite étudié
    Species
    Vulpes vulpes MSW (Red fox), Felis catus MSW (Domestic Cat), Meles meles MSW (European badger), Martes foina (stone marten), Echinococcus multilocularis (Echinococcus multilocularis tapeworm)
    Subspecies
    Canis lupus familiaris MSW (Dog)

Administrative metadata

Data creatorAffiliation
Jenny KnappChrono-environnement (FRA)
ContributorsAffiliationRole
Patrick GiraudouxChrono-environnement (FRA)related person
Benoît CombesELIZ (FRA)related person
Gérald UmhangANSES - LNR Echinococcus (FRA)related person
Franck BouéANSES - LNR Echinococcus (FRA)related person
Laurence MillonCHRUB (FRA)related person
Francis RaoulChrono-environnement (FRA)related person
Publisher : Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
Labels : Centres Nationaux de Référence, Institut Ecologie Environnement
Science contact : Jenny Knapp e-mail
Computing contact : Sylvie Damy website e-mail
Project and funder :
Access : available

Technical metadata

Formats : text/csv
Data acquisition methods :
  • Observational data :
    Les échantillons ont été collectés sur le terrain. Un code leur a été alors attribué, ils ont été géoréférencés, l'identification morphologique de l'hôte carnivore réalisée, ainsi que l'estimation de la fraicheur, le tout consigné sur le terrain.
  • Experimental data :
    La détection du parasite et le test fécal de l'hôte ont été réalisés par biologie moléculaire utilisant la méthode de PCR en temps réelle basée sur la détection spécifique de l'ADN recherché.
Datatype : Dataset
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